反相色譜柱采用全覆蓋的鍵合硅膠填料，因此具有優異的穩定性，均勻的涂層確保了固定相具有高選擇性和率的分離特點。下面分享兩點如何選擇反相色譜柱的方法：
　　1．反相色譜柱的柱子的PH值使用范圍
　　反相色譜柱優點是固定相穩定，應用廣泛，可使用溶劑。但硅膠為基質的填料，使用時一定要注意流動相的PH范圍。一般的C18柱PH值范圍都在2-8，流動相的PH值小于2時，會導致鍵合相的水解；當PH值于7時硅膠易溶解；經常使用緩沖液固定相要降解。一旦發生上述情況，色譜柱人口處會塌陷。同樣填料各種不同牌號的色譜柱不盡相同。如果流動相PH較高或經常使用緩沖液時，建議選擇PH范圍大的柱子，例如戴安公司的Acclaim柱PH2-9或Zorbax的PH2-11.5的柱子。
　　2．反相色譜柱填料的端基封尾（或稱封口）
　　把填料的殘余硅羥基采用封口技術進行端基封尾，可改善對極性化合物的吸附或拖尾；含碳量增高了，有利于不易保留化合物的分離；填料穩定性好了，組分的保留時間重現性就好。如果待分析的樣品屬酸性或堿性的化合物，選用填料經端基封尾的色譜柱。